Genom HCV-a predstavljen je jednolančanom pozitivno nabijenom RNA koja kodira 3 strukturna (jezgra nukleokapsidnog proteina i nukleoproteini ovojnice E1-E2) i 5 strukturnih (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5) proteina. Za svaki od ovih proteina, koji se nalaze u krvi pacijenata s virusnim hepatitisom C, sintetiziraju se AT-i.