Određivanje antitijela na tiroidna mikrosomska frakcija se koristi za dijagnosticiranje autoimuni tiroiditis hipotireoze i, u kojem je nivo protutijela u krvi povećava. Antitijela na mikrosomima štitnjače formiraju imuno komplekse na površini stanice aktiviraju komplement i citotoksični limfociti, što dovodi do uništavanja stanica i stvaranje upalnog procesa u štitnjače.