Atonija i paraliza jednjaka su uvjeti koji karakteriziraju funkcionalni poremećaji neuromuskularnog aparata jednjaka, čiji su uzroci toliko brojni da se ne mogu posvetiti potpunoj sistematizaciji.
Mehanička oštećenja jednjaka jedna je od najozbiljnijih ozljeda, što često dovodi do smrti, iako je pravodobno i potpuno provedeno liječenje. Anatomska oštećenja jednjaka (ozljede, rupture, perforacije stranih tijela) pripadaju nadležnosti toraktičkih kirurga
Plummer sindrom - Vinson karakteriziran atrofije sluznice usta, ždrijela i jednjaka i pokazuje više mogućnosti sustava: poremećaja gutanja, disfagija, peckanje na jeziku
Trofne bolesti jednjaka nastaju kao posljedica djelovanja lokalnih ili općih patogenih čimbenika i manifestiraju se različitim patomorfološkim promjenama u njegovoj sluznici i dubljim slojevima.
Kontakt ezofagealni čir - rijetke bolesti, koja se javlja kao posljedica produženog kontakta pritiskom jednjaka zid koji se nalazi između prednje ploče i stražnjoj krikoidna - VI tijelo vratnog kralješka.
Scleroderma iz jednjaka - jedna od manifestacija sistemske skleroderme - progresivna bolest karakterizirana promjenama vezivnog tkiva s razvojem skleroze i uništavanja lezija arteriola.