Klinička dijagnoza je pouzdana samo za krupnu upalu pluća, ali vjerojatnost pneumokokne etiologije pneumonije, otitis, sinusitis u zajednici iznosi 60-80 °. Potvrditi dijagnozu može temeljiti samo na rezultatima istraživanja mikrobiološke odgovarajućih biosubstrate: rinitis - nazalna pražnjenje (moždani udar), s otitis, sinusitis - gnojnog eksudata, s upalom pluća - sputum, meningitis - cerebrospinalna tekućina.