Aktivirani protein C cijepa faktore Va i VIIIa, čime se inhibira proces zgrušavanja. Bilo koja od nekoliko mutacija faktora V uzrokuje otpornost na aktivirani protein C, čime se povećava sklonost trombozi. Najčešća mutacija faktora V je Leydenova mutacija. Homozigotne mutacije u većoj mjeri povećavaju rizik od tromboze od heterozigota.