Komplikacije iz žučnog sustava nakon transplantacije jetre razvijaju se u 10-20% slučajeva. To uključuje restrikcije, iscjedak žuči, fistula i kolangitis. Može doći do anastomozne suženja tehničke greške zbog, zbog isteka upale žučnih i fibroze i strikture, ne anastomoze, anastomoze gore dobivenog vrata u smjeru jetre uzrokovanog ishemijom, u nekim slučajevima kanale.