U slučaju čestih pogoršanja pijelonefritisa (više od dva unutar 6 mjeseci), prevencija pijelonefritisa sastoji se u propisivanju mjesečnih profilaktičkih tečajeva (1-2 tjedna) antibakterijskih sredstava, međutim, trenutno nisu dobiveni pouzdani podaci koji ukazuju na preporučljivost takvih tečajeva.