U nekim slučajevima, češće kod žena, akutni pijelonefritis počinje akutnim cistitisom (učestalo i bolno mokrenje, bol u mjehuru, terminalna hematurija). Ostali simptomi akutnog mijelonefritisa: opći umor, slabost, bolovi u mišićima i glavobolje, gubitak apetita, mučnina, povraćanje.