Kod kongenitalne citomegalovirusne infekcije, priroda zahvaćenog fetusa ovisi o trajanju infekcije. Akutna infekcija citomegalovirusom u majke u prvih 20 tjedana trudnoće može dovesti do ozbiljnih bolesti fetusa, a rezultat su spontani pobačaj, smrt fetusa, mortvorozhdenie, nedostaci, u većini slučajeva, nespojiva sa životom. Kada je infekcija s citomegalovirusom u kasnoj trudnoći, prognoza za život i normalni razvoj djeteta je povoljnija.