EEG analiza se provodi tijekom snimanja i konačno po njegovom završetku. Tijekom snimanja procjenjuje se prisutnost artefakata (indukcija strujnih polja mreže, mehanički artefakti pomicanja elektroda, elektromiogram, elektrokardiogram itd.) te se poduzimaju mjere za njihovo uklanjanje. Procjenjuje se frekvencija i amplituda EEG-a, identificiraju se karakteristični grafički elementi te se određuje njihova prostorna i vremenska distribucija.