H. influenzae su gram-negativne pleomorfne štapićaste ili kokoidne stanice veličine (0,2-0,3) x (0,5-2) µm. U razmazima se nalaze pojedinačno ili u parovima, a ponekad u obliku kratkih lanaca i skupina. Na gustim medijima tvore male (do 1 mm u promjeru) okrugle bezbojne kolonije. Mikroorganizmi su nepokretni, ne tvore spore, ali je moguće stvaranje kapsularnih oblika, s kojima su povezana patogena svojstva. Patogen proizvodi endotoksin, čijim se nositeljem smatraju kapsularni polisaharidi.