Nastaje kao posljedica nedovoljne stimulacije funkcije jajnika gonadotropnim hormonima (GH) hipofize. Smanjena ili neadekvatna sekrecija GH od strane hipofize može se uočiti kod oštećenja njezinih gonadotropa ili kod smanjene stimulacije gonadotropa luteinizirajućim hormonom hipotalamusa, tj. sekundarna hipofunkcija jajnika može biti hipofizne geneze, hipotalamičke i, češće, miješane - hipotalamičko-hipofizne.