Fekalna inkontinencija može biti posljedica ozljede ili bolesti leđne moždine, kongenitalnih poremećaja, slučajne ozljede rektuma i anusa, rektalnog prolapsa, dijabetesa, teške demencije, fekalne impakcije, opsežnih upalnih procesa, tumora, opstetričkih ozljeda i operacija koje uključuju rezanje ili širenje analnog sfinktera.